Sicuro? Pure se lo vedi con Firefox?
Explorer (almeno fino alla versione 6, vedremo ora con la 7) è famoso per l'intepretazione degli standard web "a gusto suo". Può darsi benissimo che la trasparenza ci sia e sia fatta bene ma sia lui che non la faccia vedere:
http://www.pc-facile.com/forum/viewtopi ... sparen+png
Se così fosse c'è poco da fare: gli unici due formati di immagine per internet che hanno il canale alpha (=trasparenza) sono GIF e PNG.
Se ti andasse di complicarti un po' la vita potresti fare un javascript che controlli il browser e mostri la GIF se l'utente ha Explorer fino alla versione 6 e la PNG per chi ha Firefox o IE7
PS: non ho avuto occasione di provare IE7, magari si vede l'azzurrino pure lì