Probabilmente non riesci ad eliminarle perchè sono "in uso", ovvero il Sistema Operativo le sta utilizzando per il funzionamento della macchina. In alternativa, potrebbe anche essere che tu non abbia diritti di amministratre e per quella sezione di registro sia definita una policy che preclude le modifiche.
Nel secondo caso (per motivi "etici"), è il caso di chiedere ad un amministratore di sistema, se invece sei già admin e comunque non riesci... l'unica via è killare le voci "da offline".
Potrebbe forse esserti utile
questo topic (in inglese), in alternativa, puoi sempre scaricare utility come Offline NT Password Recovery (
http://home.eunet.no/pnordahl/ntpasswd/).
In buona sostanza, si masterizza un'immagine ISO (che di solito si scarica già pronta) e poi si fa boot dal CD appena creato; In quel modo puoi accedere a tutto il registro senza il rischio di trovarne parti utilizzate.
Il programma che ti ho segnalato è a linea di comando, bisogna avere uan certa pazienza, specialmente quando si tratta di digitare i nomi di chiavi con caratteri particolari (tipo le parentesi graffe) o lunghi una cinquantina di caratteri... ce ne sono comunque altri: puoi provare su Google, digitando ad esempio "Offline Registry Edit", o cose simili.
Va da sè che bisogna prestare la massima attenzione a quel che si fa, questi interventi sono molto delicati!
Ciao,
MAx